實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)是一種高靈敏度、高精確度的分子生物學(xué)技術(shù),用于檢測(cè)和量化DNA或RNA的數(shù)量。該項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)廣泛用于生物相關(guān)行業(yè)的檢測(cè)項(xiàng)目中,其中就包括支原體檢測(cè)。
我們都知道,支原體污染對(duì)于細(xì)胞相關(guān)的臨床項(xiàng)目危害巨大,支原體檢測(cè)是項(xiàng)目申報(bào)的必要環(huán)節(jié)。實(shí)現(xiàn)檢測(cè)的高靈敏度、高特異性,并盡可能縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間,是非常有意義的。
藥典方法中,培養(yǎng)法和指示細(xì)胞法都各有缺點(diǎn),而qPCR方法兼顧了二者的優(yōu)點(diǎn),受到眾多從業(yè)人員的青睞。那么在實(shí)驗(yàn)過程中,有哪些注意事項(xiàng)?本期內(nèi)容,以德國(guó)Minerva Biolabs公司生產(chǎn)的Venor Gem qEP為例,盤點(diǎn)qPCR檢測(cè)支原體的關(guān)鍵點(diǎn)。
Venor Gem qEP試劑盒能檢測(cè)多種支原體、靈敏度高、遵循歐洲藥典流程要求。
Part.01 樣品處理
一般來說,該試劑盒適用于細(xì)胞、細(xì)胞培養(yǎng)上清等物質(zhì)的支原體檢測(cè)。
當(dāng)細(xì)胞長(zhǎng)至80%-90%時(shí),收集樣品。此時(shí)可對(duì)樣品進(jìn)行95℃的孵育處理。
需要注意的是:細(xì)胞培養(yǎng)產(chǎn)物中可能存在PCR抑制物質(zhì),例如:細(xì)胞顆粒、較大的樣品體積或其他生物材料(疫苗、石蠟包埋樣品等)、胎牛血清含量>5%等情況,需要在進(jìn)行PCR之前,對(duì)樣品進(jìn)行DNA提取處理,以盡可能減輕無關(guān)因素對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的干擾。
這里推薦試用配套的德國(guó)MB支原體提取試劑盒:
有小伙伴可能會(huì)產(chǎn)生疑問:培養(yǎng)基中的青霉素或者鏈霉素,會(huì)不會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生影響?
就目前有記錄的研究結(jié)果而言,沒有發(fā)現(xiàn)常用的“雙抗"會(huì)對(duì)檢測(cè)的靈敏度等造成影響。
Part.02 反應(yīng)體系建立
在進(jìn)行支原體qPCR檢測(cè)時(shí),需要設(shè)置合適的反應(yīng)體系和條件。反應(yīng)體系包括Mix、樣品DNA、緩沖液、內(nèi)控等組分。反應(yīng)條件包括擴(kuò)增溫度、時(shí)間、周期數(shù)和熒光信號(hào)閾值等參數(shù)。
需要注意的是:需嚴(yán)格按照使用說明中的參數(shù)進(jìn)行設(shè)置。隨意更改數(shù)值可能會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
Part.03 結(jié)果解釋
FAM通道:檢測(cè)支原體熒光信號(hào)。
HEX通道:檢測(cè)內(nèi)控對(duì)照熒光信號(hào)。
需要注意的是:支原體DNA和內(nèi)控DNA存在信號(hào)的競(jìng)爭(zhēng)性抑制。支原體DNA越多,F(xiàn)AM通道信號(hào)越高,檢測(cè)內(nèi)控對(duì)照的HEX通道信號(hào)越低。
定量需基于Ct值和DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線。
Ct<40為陽性結(jié)果。Ct≥40為陰性結(jié)果。